اداره نظارت برمواد غذایی آرایشی و بهداشتی نیز به عنوان زیر مجموعه معاونت غذا و دارو و دانشگاه، پیرو رسالت یادشده، می باشد،. لذا ارتقاء کیفیت خدمات و وظایف محوله را در جهت افزایش رضایتمندی ارباب رجوع سرلوحه کارخود می داند. بر این اساس، ضمن حرکت در چارچوب قوانین و اهداف تعریف شده وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی و سیاستهای برنامه های توسعه، اهداف کلی به شرح زیر را مد نظر دارد. اهداف کلی : ارتقاء و توسعه سلامت اقلام سلامت محور و پیگیری به موقع شکایات، افزایش سرعت، دقت و کیفیت اجرای فرایندها در راستای افزایش رضایت ارباب رجوع و افزایش کارایی و کاهش هزینه ها

نظارت بر حسن اجرای آئین نامه‌ها و ضوابط مرتبط با امور داروخانه‌ها و شرکت‌های پخش دارو نظارت بر عملکرد داروخانه‌های بخش دولتی (مراکز آموزشی درمانی و بیمارستان‌ها) و خصوصی در زمینه نحوۀ ارائه خدمات دارویی و ارزشیابی داروخانه ها درجهت ارتقاء خدمات دارویی نظارت بر عملکرد شرکت‌های پخش دارویی در زمینه نحوۀ توزیع دارو برگزاری کمیسیون قانونی امور داروخانه ها (کمیسیون ماده ۲۰ ) به منظور تصمیم گیری در خصوص موارد مربوط به کمیسیون و اجرای آیین نامه ها، ضوابط و دستورالعملهای مرتبط با امور داروخانه ها تکمیل مدارک متقاضیان واجد شرایط تاسیس داروخانه به منظور صدورموافقت اصولی بر اساس ضوابط و مقررات صدور و تمدید مجوزهای مربوط به داروخانه‌ها (مجوزهای تأسیس، مسئول فنی) تهیه، نگهداری و توزیع داروهای مخدر به واحدهای تابعه دانشگاه (بیمارستانها و مراکز جراحی)و تحویل داروهای مخدر به بیماران صعب‌العلاج تأمین داروهای مخدر مورد نیاز مراکز درمان سوء مصرف مواد بخش دولتی و خصوصی و نظارت بر نحوۀ مصرف داروهای مذکور مورد نیاز بیماران مبتلا به سوء مصرف مواد مخدر تخصیص سهمیه برخی از داروهای خاص و مشمول سهمیه بندی به داروخانه‌های منتخب و اطلاع رسانی لازم . صدور مجوز (حواله) خرید الکل توسط واحدهای صنعتی مصرف کننده الکل طبی و نظارت بر نحوه مصرف آن توزیع کالابرگ شیر مصنوعی یارانه‌ای به واحدهای تابعه دانشگاه و نظارت بر توزیع شیر مصنوعی توسط شرکت‌های پخش دارو رسیدگی به کمبودهای دارویی اعلام شده از طرف واحدهای تابعه و ارسال به سازمان غذا و دارو رسیدگی به شکایات مردمی در زمینه امور مربوط به خدمات دارویی داروخانه‌ها و ارجاع پرونده‌های متخلفان به مراجع ذیصلاح همکاری‌های بین بخشی با سازمان‌های بیمه گر و مراجع قضایی و نیروی انتظامی و ارگان‌های بازرس در زمینه اعلام قیمت داروها و لوازم مصرفی پزشکی و داروهای مکشوفه غیر مجاز و قاچاق و تقلبی که مواد اولیه و نیز مراحل ساخت، انبارداری، حمل و نقل و توزیع آنها مورد تایید نبوده ،وامحاء آن‌ها بررسی و تکمیل مدارک مربوط به مجوز فعالیت شرکت های داروسازی در زمینه(واردات و تولید) دارو/ ملزومات دارویی /فرآورده های بیولوژیک-بررسی و تکمیل مدارک مربوط به موافقت اصولی احداث کارخانه های داروسازی در زمینه دارو / ملزومات دارویی-بررسی و تکمیل مدارک صدور پروانه مسئول فنی شرکت های داروسازی-بررسی و تکمیل مدارک اصلاح و تمدید پروانه مسئول فنی شرکت های داروسازی-تکمیل مدارک صدور ، تمدید و ابطال مجوز اولیه (موافقت اصولی ) تاسیس داروخانه-نمونه بردای از فرآورده های وارداتی و تولیدی دارو و ملزومات دارویی جهت ارسال به آزمایشگاه مرجع-بررسی و تکمیل اصلاح و صدور پروانه تاسیس کارخانه داروساز-بررسی پرونده جامع محصولات ضدعفونی کننده کارشناسی مناطق تحت پوشش دانشگاه از نظر نیاز به داروخانه نظارت بر ترخیص کالاهی پستی و همراه مسافر از گمرک فرودگاه امام خمینی(ره) اعلام موارد داروهای مورد فراخوان (Recall) و نظارت بر حسن انجام فراخوان در داروخانه های دولتی و خصوصی و شرکت‌های پخش دارو ارائه پیشنهادات جهت تدوین و تنظیم آیین نامه ها و ضوابط و رفع ابهامات و ایرادات در ضوابط پیشنهادی به وزارت متبوع

فرآورده ­های طبیعی، گیاهی، سنتی و مکمل به عنوان بخش جدانشدنی از درمان در کنار دیگر داروهای شیمیایی قابل استفاده برای بیماران و به صورت عمومی در دسترس مردم قرار می­گیرد. نظارت، بازرسی و پایش بر کارخانه ­های تولیدی، شرکت ­های صاحب پروانه، مراکز پخش و داروخانه ها از اهم فعالیت­های اداره فراورده ­های طبیعی، سنتی، مکمل و شیر خشک می­ باشد. علاوه بر فعالیت در حیطه نظارت و بازرسی، بررسی اولیه پرونده درخواست صدور یا تمدید پروانه ساخت فراورده­های طبیعی، سنتی و مکمل نیز از وظایف سازمانی این اداره می­باشد. بخش دیگر از فعالیت­های این اداره شامل نظارت بر توزیع عادلانه و در دسترس بودن شیرخشک­های رژیمی و غذاهای ویژه می­باشد. اداره کل امور فرآورده های طبیعی، سنتی و مکمل با اهتمام به مدیریت دانش در بخش نظارت و استفاده از توان داخلی و افزایش سطح سواد و آگاهی افراد متخصص و غیر متخصص جامعه و با هدف ارتقاء سلامت و کیفیت فرآورده­های طبیعی، سنتی و مکمل تغذیه ای، فرآورده های ویژه بیماران متابولیک، شیرخشک رژیمی و غذاهای ویژه در سازمان غذا و دارو وظیفه خدمت رسانی به شهروندان را به عهده دارد و لذا بر اساس وظیفه ذاتی خویش اطلاعات مورد نیاز را به منظور آشنایی با این فرآورده ها و نحوه تهیه آنها، به اطلاع عموم می­رساند. با نظارت و پایش مستمر و پیوسته این معاونت حصول استفاده حداکثری از منابع انسانی و امکانات در جهت اطلاع رسانی و آموزش همگانی، تولید محصولات طبیعی، سنتی و مکمل مطابق با استانداردهای علمی معتبر و برابر با دستورالعمل­های سازمان غذا و دارو وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی کسب اطمینان لازم در خصوص امنیت کالاهای سلامت محور و در نهایت ارتقای نظام کیفیت خدمات به دست خواهد آمد. از مهم­ترین اهداف این اداره شعار زیر می باشد: "ارائه خدمت با دقت و سرعت در راستای حفاظت از سلامت و بهداشت جامعه"

رسالت این واحد، ساماندهی وضعیت تجهیزات و ملزومات پزشکی مصرفی در چارچوب قوانین، ضوابط و دستورالعمل های ابلاغی درسطح مراکز درمانی تابعه در راستای بهبود خدمات ارائه شده به بیماران و نظارت بر نحوه تامین، توزیع، عرضه، مصرف، نگهداشت، کیفیت، ایمنی و اثربخشی این وسایل در این مراکز است .از دیگر اقدامات مدیریت تجهیزات پزشکی معاونت غذا و دارو دانشگاه علوم پزشکی تهران، می توان به نظارت برتجهیزات و ملزومات پزشکی در مراکز درمانی با‌ انجام بازدیدهای ارزیابی مراکز دولتی و خصوصی، رسیدگی به شکایات واصله و ارجاع موارد تخلف به اداره کل نظارت و ارزیابی تجهیزات پزشکی و مراجع قانونی اشاره نمود.

آزمایشگاه کنترل غذا، دارو، تجهیزات پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران در سال های آتی، بدنبال بهبود و ارتقاء کیفیت و ایمنی محصولات غذایی، دارویی و پزشکی است. با پیشرفت تکنولوژی و تحقیقات علمی، دستیابی به روش‌های جدیدتر و دقیق‌تر برای بررسی ایمنی و کیفیت محصولات غذایی، دارویی و کیتهای آزمایشگاهی در برنامه این مدیریت قرار دارد. همچنین، ارتقاء سطح آزمایشگاه های کنترل کیفیت محصولات کارخانجات تولیدی، از جمله اهداف آینده این مدیریت می باشد. با توسعه تکنولوژی‌های مختلف مانند هوش مصنوعی، مدل‌سازی سه بعدی و استفاده از داده‌های بزرگ بدست آمده از دستگاه های پیشرفته، بررسی ایمنی و کیفیت محصولات بهبود می‌یابد و این امر، بهبود در کیفیت زندگی آحاد مردم را بدنبال خواهد داشت. باارتقای توانمندی‌های آزمایشگاهی و تکنولوژی‌های مورد استفاده، انتظار می‌رود که آزمایشگاه کنترل غذا، دارو، تجهیزات پزشکی علوم پزشکی تهران در آینده بتواند نقش بسیار مهمی در حفظ سلامت عمومی و بهبود کیفیت زندگی در کشور ایفا کند.